Werner is opgegroeid in Zeeuws Vlaanderen, waar hij als voorzitter jarenlang actief is geweest voor de JOVD (liberale jongeren). Werner studeerde geschiedenis in Leiden met als afstudeerspecialisatie Vaderlandse Geschiedenis. Gehuwd met Antoinette In het dagelijks leven werken ze samen in hun bedrijf aan huis (Kouwenaar Advocatuur).

Werner heeft een grote politieke belangstelling en dit heeft erin geresulteerd dat hij in de periode 2006 tot 2010 actief was als gemeenteraadslid voor de VVD in de gemeente Nijkerk met als portefeuille Grondgebied. Momenteel vervult hij met veel plezier het voorzitterschap van de schermvereniging Fencing Ermelo. Tevens is hij lid van de Geschillencommissie Labradorkring Nederland. Werner is lid van de Herensociëteit Amicitia(Amersfoort).